目前为止，最早记载三坑巡检司职官当数《土官底薄》、《明实录》，其次民间《务川邹氏族谱》、《务川申氏族谱》、《务川正南桥谢氏族谱》均有零星记载，从元朝末年至成化年间，明以前的职官无考。
（一）申世隆（1290-？）明朝首任
《四库全书•土官底簿》(以下称土官底薄)卷下第71页：“都濡、五堡、三坑等处巡检司巡检：申世隆原三坑圗人，前任大萬山長官司長官。”这个底簿解读为，申世隆先任大万山长官司长官，后转入三坑图任三坑巡检。《湖南通史古代卷》明代湖南P529：“元末五寨长官昭信校尉田儒铭，于明洪武元年(1368)率5子2孙，首先献地，并帮助进剿周文贵，招降中林、验洞、万山、草子、朗溪等处苗人，遂授沱江宣抚使，‘以五子从征有功，各赐土分守。’”这可间接证明申世隆正是此时（洪武元年）及以前，任于大万山长官司长官，并在田儒铭的劝导下，投诚朱元璋，并得以并转任务川县知县。至少在洪武五年前申世隆去世，荫其子申应斌任三坑巡检。《土官底薄》不载，说明其是在洪武五年前得任，因为土官底薄也只记洪武五年后的事。
《嘉靖贵州通志》卷一载：大萬山長官司，元置大万山苏葛办等处军民长官司隶思州军民宣抚司。《铜仁府志》《万历贵州通志》明洪武五年(1372年)改大万山苏葛办等处长官司为大万山长官司（治今贵州省万山特区）。考明初思州宣抚司属下多个长官司长官，均为元末原官，如《中国土司制度史下编①》第764页：乌罗长官司长官杨金万，洪武初年归附仍授本司正长官。推之，申世隆是于元代末任大万山苏葛办等处长官司长官（正六品）。投诚后，得改任务川知县，品秩及明初复授旧朝遗官的规定都相符。申氏谱所载：“世隆南征有功，因官入籍黔省。”又“始祖世隆入黔任务川县令，…”。因此只能推断申世隆是任大万山苏葛办等处长官司长官（六品），其于洪武元年投诚后，或转任务川知县，随即去世或致仕，荫其子申应斌任三坑巡检（从九品），并于其间卜居火炭丫。巡检是从九品，而申世隆是六品，这也可证明申世隆并没有获得土官认可，朱元璋对元朝投诚的官员，均保留其原品秩，并可享受荫一子入官的待遇。按明初荫子规定，六品官荫子只能为从九品或不入流的杂职。结合《土官底薄》的记载与申世隆祖孙三代的任职记录，推定申世隆为申氏入务邑始祖，因官入籍。其卜居火炭丫与任三坑巡检十分关联。
《万历贵州通志》载：谢鼎新，本县官籍，前元任本县知县。男，谢复隆，以宣慰田仁智保任主簿（仁智卒于洪武九年），三世孙谢政弼，以田大雅保任思南千户所百户（与《土官底薄》完全一致）。因田仁智是首任思南宣慰司宣慰使。从谢鼎新儿孙获保举袭职情况来年，其于前元任务川县知县之记载是可信。
从谢鼎新（六品）其子谢复隆（六品）孙谢政弼（六品），袭职保留原品秩，是属土官承袭方式。申世隆为正六品，而其子为巡检（从九品），说明申世隆不算土官，没有享受土官承袭的待遇。只能符合明初“廕叙递降（《大明会典》卷之六•阴叙）”规定，正六品官员，可荫子于未入流上等职内叙用的规定。这更加确定了申世隆卒于洪武初年的推断。
（二）申应斌（1325?-1402）袭任都濡五堡三坑等处巡检司巡检。
申世隆之子，名申应斌，是否得以继任三坑之职？目前未能查阅至相关记录。但申世隆卒于洪武初年（1368），那么直到永乐元年（1403）四月申俊继任三坑巡检职，间隔近三十年时间，如果此期为别姓任此职，那么可能就没有永乐元年四月申俊继任之事了。因为土官底薄也只记洪武五年后的事，所以推断，申应斌应该是在洪武五年前就任三坑巡检，得到思南宣慰司田氏的保举而任三坑巡检职。申应斌，邵阳申氏谱载，原名申儒葵，寓意将来不要象其父世隆那样做个武官。可是后来只能荫袭巡检职（武职），所以儒葵改为应斌。这个推测十分可信。
那么至少可以证明，申应斌死于永乐元年。申氏族谱载：申朝奉生于宋开庆元年(1259年)已未岁正月初二寅时，卒于元大德三年（1298）已亥岁，失寿四十一。据邵阳申氏谱载，申朝奉于1290生世隆，即申世隆至永乐元年时已经112岁。这显然不符合当时的情况，所以申世隆之子申应斌是一定于洪武初年，因父官六品而得以荫官任三坑巡检司巡检职务的。洪武年间，对西南各地方官，不管是从元代世代承袭的，还是因功授官的，后都承认其世袭。故至永乐元年定为申应斌卒年后，随即其子申俊得以继任三坑巡检之职（土官的承袭方式），故申应斌的卒年推断为永乐元年，是完全可信的。
（三）申俊（1355？-1428）于永乐元年任三坑巡检司巡检
《土官底薄》载：“申俊，係世隆孫男，該宣慰使田大雅，舉保到部，永樂元年四月除授前職。”考《明史》载，田大雅为洪武十一年袭职（思南宣慰使职），永乐元年（1402）刚好在建文帝对巡检司进行大量的裁撤，务川只保留了一个“三坑巡检司”。所以此时职名与洪武十三年前的名称是一样的，故称除授前职。
从建文帝三年（1401）“省思南府都儒、五保、三坑等处巡检司为三坑巡检司及婺川县丞簿各一人”起，务川都濡、五保、三坑等处巡检司已经撤销，仅保留三坑巡检司，且为土官（其继任过程都列入土官底薄）。
（四）申天棋（1385？--1442）于永乐二十六（1428）年袭三坑巡检。
申天棋，为申俊长子，是任职正史无考，但前述务川县境内几个大姓如邹、申、谢族谱均有记载，邹、谢二谱是以婚嫁记载而载明申天棋为巡检。
申俊自永乐元年四月除授本职至永乐二十六（1428）年寿终（也是七十以上），由其长子申天祺继任，至正统七年（1442）去世。
（五）申祐（1402-1449）于正统七年得袭职
《土官底薄卷下》：“正统七年保男监生申祐袭职，本部参得不系世袭，奏准立案。”此时为什么要保申祐继任，而不保申天祺的儿子继任，其主要原因应该还是三坑巡检司已经明确为非土官性质了，名义上朝廷坚持不得世袭。保申祐任，是因为申祐具备出任流官的功名（正统三年时已经考得举人），所以贵州布政司，按察司审查，符合承官条件，才结状保任申祐到吏部。如《土官底薄》载：正统七年保男监生申祐袭职，本部参得不系世袭，奏准立案（表明虽然不得世袭但不是批准申祐任此职）。申祐正统七年入国子监后，才获得贵州三司提名，以监生身份拟任三坑巡检，虽获得批准，而申祐本人并未到职而是继续国子监的学业。此期巡检之职亦可推定实际是申秧在履行。
（六）申秧获贵州三司保举提名拟任三坑巡检司巡检。
景泰四年，三司（ 承宣布政使司,提刑按察使司,都指挥使司）保嫡孙申秧袭职，本部仍参得不系世袭,三月二十九日奏准发回为民。这表明三坑巡检司已经是流官性质了。但申氏谱，邹氏谱均载申秧为巡检，这个记录也有可信的一面，因为作为任朝廷命官没能通过，地方为维持三坑巡检司的工作，可能采取变通的措施，所以申秧实际行使了三坑巡检工作。
也表明申祐之任职，不是承袭，而是授流官的，为了驱除“申祐承袭申天祺的巡检之职”的表面现象，吏部特加“本部参得不系世袭”。所以有后来的景泰四年三司瑞保申俊的嫡孙申秩承袭时，有“奏准發回為民”的彻底否决了承袭。
综上所述，申氏任三坑巡检司巡检更替时间表为：
申世隆洪武元年投诚转任务川县职，随即致仕荫子申应斌（洪武五年（1372）以前任→申俊（永乐元年四月起任）→申天祺（洪熙元年任）→申祐（正统七年任）→申秧→改流官任（非申姓）。
附有关史料：
《嘉靖贵州通志》务川条载：三坑巡检司巡检一员，吏一员。这说明两个史实，一是都濡、五堡二巡检已经废止了，二是巡检为流官，因为没标明土巡检字样。
《万历贵州通志》公署载：都濡、五堡、三坑等处巡检司，府北三百七十里，隶婺川县。职官条载：三坑、偏刀、板桥三巡检司各巡检一员。
《道光思南府续志》载都濡五堡三坑巡检司巡检：杨明善、袁正安、王廷佐（四川人，持守清能。升开封府知府）张冲霄、袁万春（嘉靖）杨达。
《大明会典》卷之六 【土官承袭】土官承袭、原俱属验封司掌行。洪武末年、以宣慰宣抚安抚长官等官。皆领土兵。改隶兵部。其餘守土者、仍隶验封司。凡各处土官承袭。洪武二十六年定、湖广四川云南广西土官承袭、务要验封司委官体勘、别无争袭之人、明白取具宗支图本、并官吏人等结状、呈部具奏。照例承袭。移付选部附选。司勋贴黄。考功附写行止。类行到任。见到者、关给札付、颁给----这是因为《土官底薄》为兵部所存底薄辑录成册，所以洪武时期申祐曾祖世隆、祖应斌的任职不详。
